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日本的高等教育是从完成初等教育(小学6年)以及中等教育(初中3年，高中3年)这12年之后开始的。留学生可以入学的高等教育机关有:①高等专门学校、②专修学校(专业课程)=专门学校、③短期大学、④大学(本科)、⑤研究生院等5种，大致分为国立、公立、私立。 教育制度
在高等教育机关可以取得的学位、称号以及学习年限等
| 课程 | 学位／称号* | 学习年限 | 学分数 |
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| 大学院 | 研究生院*1 | 博士 | 5年*2 | 30学分以上（包括硕士课程的修满学分） | | 硕士课程 | 硕士 | 2年*2 | 30学分以上 | | 专业课程 | 硕士（专职） | 2年 | 30学分以上 | | 法务博士（专职） | 3年 | 93学分以上 | | 教职硕士（专职） | 2年 | 45学分以上 | | 大学（学士） | 普通本科，4年制药学系 | 学士 | 4年 | 124学分以上 | | 医学、牙医学、兽医学及6年制药学系 | 6年 | 医学、牙医学：188学分以上
兽医学：182学分以上
药学：186学分以上 | | 专科大学 |
| 学士（専門職） | 4年 | 124単位以上 | | 短期大学 |
| 短期大学士 | 2年或者3年 | 2年课程：62学分以上
3年课程：93学分以上 | | 专科短期大学 |
| 短期大学士（专职） | 2年或者3年 | 2年课程：62学分以上
3年课程：93学分以上 | | 高等专门学校 |
| 准学士* | 5年或者5年半*3 |
| | 专修学校（专门学校） | 专业课程 | 高级专家* | ４年 |
| | 专家* | 2～3年 |
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大学院博士课程有可能分为前期课程(2年)和后期课程(3年)的情况。学士课程的学习年限为6年的医学、牙医学、兽医学，6年制的药学博士课程的学习年限为4年。 硕士课程和博士课程以标准年限记载。 高等专门学校的学习年限通常为5年(商船为5年半)，从第三学年开始接收留学生。 日本的学校通常从4月到第二年3月为一个学年。很多高等教育机构的学校都引进了学生评议制。
长期休假通常是夏季(7月下旬~ 9月上旬)、冬季(12月下旬~ 1月上旬)、春季(2 ~ 3月)三次。日本大部分学校都是4月入学，也有学校实行秋季入学制度。 国立、公立、私立高等教育机关数
| 国立 | 公立 | 私立 | 合计 |
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| 研究生院 | 86 | 89 | 482 | 657 |
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大学
（学部） | 86 | 101 | 620 | 807 |
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| 短期大学 | 0 | 14 | 295 | 309 |
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| 高等专门学校 | 51 | 3 | 3 | 57 |
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| 专科学校 | 8 | 180 | 2,533 | 2,721 |
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